自2000年4月正式建校后，学校领导就十分重视档案材料的积累和保管，2003年成立了上海建桥学院档案工作领导小组。2011年又调整充实了学校的档案工作领导小组。领导小组组长由校长亲自担任，校办主任任副组长，人事处、教务处、学生处、招生办、毕业生就业办、资产处、供应处及二级学院的部门负责人为领导小组成员。领导小组下设综合档案室，明确综合档案室负责日常档案管理和档案法制法规宣传工作。即：负责全校党群、行政、教学、科学研究、基本建设、仪器设备、出版、外事、财会、实物、声像等各类档案及相关资料的集中统一管理。
学校综合档案室现有专职档案员5名，负责文书档案、学生档案、教职工档案等各类档案。档案工作实行部门立卷归档制度，已形成了覆盖全校的档案工作网络，建立了一支业务水平扎实的专兼职档案员队伍。现有立卷单位31个，兼职档案员27人。兼职档案员负责各部门日常产生的各类文件材料的收集、整理、预立卷、归档工作，定期不定期地接受学校综合档案室的业务培训，并由各部门分管领导为第一责任人，形成了档案管理的二级网络。学校的档案工作步入正常化轨道，由综合档案室集中统一管理。
综合档案室现位于临港校区图书馆南区一楼，总面积为447.6平方米。办公区、阅档室、库房已做到三分开，库房分学生档案室和文书档案室。学生档案室保管2万多名在校生的学生档案以及历届遗留的毕业生档案。建校至今累计存档5万多卷（截止至2023年3月），保存了党政、教学、科研、产品 、基建、设备、出版、外事、财会、声像、实物十二大类档案。
学校档案工作坚持规范化、标准化管理的方针，2003年至今，已先后制定和健全完善了《上海建桥学院档案管理办法》、《上海建桥学院档案实体分类法》、《上海建桥学院档案工作岗位责任制》、《上海建桥学院档案归档范围的确定》、《上海建桥学院档案文件材料的部门立卷和归档流程》、《上海建桥学院部门档案预立卷制度》、《上海建桥学院档案保密安全制度》、《上海建桥学院档案借阅利用制度》、《上海建桥学院档案库房管理制度》、《上海建桥学院档案统计制度》、《上海建桥学院档案立卷部门归档范围和保管期限》、《上海建桥学院人事档案管理办法》和《上海建桥学院学生档案管理办法》等档案管理制度，对学校各二级学院（直属系）和处、室、部在收集、整理、预立卷、归档操作等方面进行了规范和要求。基本上形成了学校档案工作有法可依，部门立卷归档有章可循，档案工作依法开展的新局面。
2008年初，学校综合档案室已使用“南大之星”档案管理系统软件，为学校文件资料的管理和档案的保管利用提供了坚实的基础，初步实现了档案的现代化管理。学校在示范性高等院校达标、文明单位评选、本科教学评估等工作中，综合档案室提供了大量的、有价值的文件资料，为学校抓住机遇、谋求发展提供了文字材料的保证。
（数据截止时间为2023年3月）
